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ジョンエネルギーで開裂させ,生成したプロダクトイオンをTOF-MS で質量分離して検出する.この方法ではプロダクトイオンの精密質量を知ることができ,これらを解析することによって分子の詳細構造を知ることができる. また, Q-TOFモードを使うことによって目的成分をより選択的に検出することもできる. これは,残留農薬分析においてSIMで選択性が得られない化合物をSRMでより選択的に検出するといったものと似たようなことであるが,Q-TOFモードでは設定した範囲のプロダクトイオンをすべてモニターするため, どちらかというとトリプル四重極MSにおけるプロダクトイオンスキャンに近いイメージである. を交換するための場所があり,そこを介して真空を解除することなくイオン源を交換できる.
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